Роден е в градчето Оуенсбъроу, щат Кентъки, САЩ на 9 юни 1963 г. Той е син на Джон Кристофър – строителен инженер и Бети Сю Палмър – сервитьорка. Джони Деп има един брат – Дани и две сестри – Деби и Кристи. През 1970 г., когато Джони е на 7 години, семейството му се премества във Мирамар, Флорида, където баща му има по-добри възможности за работа. През почти цялото детство на Джони семейството му често се мести от едно място на друго, което повлиява на израстването на Деп.През ученическите си години Джони започва да се занимава с музика и свири на китара в различни училищни банди. Родителите му се развеждат, когато той е на 15 години, а недълго след това Джони напуска училище. Той започва да се занимава по-сериозно с музика и през следващата година това се превръща в основното му занимание. Той свири с групата „The Flame“, прекръстена след това на „The Kids“, която свири предимно по барове и заведения, а понякога по различни празненства. Постепенно „The Kids“ стават доста известни на местно равнище и решават да се опитат да запишат някои от своите песни. За целта младежите се насочват към Лос Анджелис като междувременно преименуват групата на „Six Gun Method“.По това време Джони Деп се жени за Лори Ан Елисън. Тя е сестра на барабаниста на групата и Лори и Джони сключват брак на 20 декември 1983 г. Отчасти сватбата става причина за допълнителни противоречия между членовете на групата, така че договор за запис така и не се подписва. След като не успяват да запишат никоя от песните си „Six Gun Method“ се разпада. След това Джони се присъединява за кратко към няколко други групи, но никъде не се застоява за дълго.След като Джони Деп и Лори се преместват да живеят заедно, Лори започва да работи като гримьорка, а Джони сменя множество различни професии. След това Лори запознава Джони с актьора Никълъс Кейдж, който съветва Деп да се насочи към актьорската професия, за да може да издържа себе си и жена си. Филмовата кариера на Джони започва бавно, а междувременно през 1985 г. се стига до развод между Джони и Лори. От 1999 г. той живее заедно с Ванеса Паради, от която има две деца – Лили-Роуз и Джак. Малко преди да заживее с Ванеса, Джони има кратка връзка с манекенката Кейт Мос.За първата роля на Джони Деп му помага Никълъс Кейдж, който решава, че Джони има бъдеще като актьор и го запознава със своя агент. Това довежда и до участието на Деп във филма „Кошмар на Елмстрийт“ (Nightmare on Elm Street), който е завършен през 1984 г. След края на снимките на филма Джони използва парите от хонорара и за пръв път в живота си отива на уроци по актьорско майсторство в Loft Studio, Лос Анджелис. Джони Деп успява да получи малка роля във филма на Оливър Стоун „Взвод“ (Platoon), който по-късно е отличен с награда Оскар.Въпреки че постепенно Джони се насочва към актьорската професия, той не престава да свири през свободното си време заедно с групата „Rock City Angels“. След края на снимките на „Взвод“ Джони получава важна роля във телевизионния сериал „21 Jump Street“. Интересно е, че първоначално Джони отхвърля предложението за участие в сериала, тъй като смята, че е по-добре да се снима в киното. Въпреки че първоначално ролята е дадена на друг, неуспеха на първите снимки насочва отново авторите на сериала към Джони Деп. Този път той приема, но с уговорката, че ще се снима само в продължение на година. Сериалът разказва за група детективи, които се борят срещу младежката престъпност. Филмът е предназначен за по-млада аудитория и скоро Джони Деп става добре известен на голяма част от младите хора в САЩ. След като сериалът се превръща в хит, а лицето на Джони става много добре известно, той продължава да се снима в сериала не 1 година, а 3.През 1990 г. той участва във филмите „Едуард Ножиците“ (Edward Scissorhands) и „Cry-Baby“. Постепенно Джони Деп започва да получава по-често предложения за участие в нови филми. За играта си във филма „Едуард Ножиците“, Джони е номиниран за награда Златен Глобус. След това той участва във филма на Ласе Хелстрьом „Защо тъгува Гилбърт Грейп?“ (What's Eating Gilbert Grape?), в който участва и Леонардо ДиКаприо, както и във филма „Аризонска мечта“ (Arizona Dream) на Емир Кустурица. Играта му в „Аризонска мечта“ е високо оценена от критиците. Джони Деп участва и в "Ед Уд" („Ed Wood“), където играе и Мартин Ландау. За играта си във филма Мартин Ландау е отличен с награда Оскар.През 1995 г. Джони участва във филма „Новият Дон Жуан“ (Don Juan DeMarco), където партнира на Марлон Брандо. Този, както и следващия филм – „Мъртъв“ (Dead Man) са много добре приети от критиката. След тези свои изяви Джони Деп се превръща в един от най-популярните кино-артисти в края на 1990-те години.През следващите години Джони доказва още едно свое качество като актьор като се снима в множество филми, където има изключително различни една от друга роли. Филмът с негово участие „Страх и ненавист В Лас Вегас“ (Fear And Loathing In Las Vegas), където партнира на Бенисио Дел Торо, се превръща в хит и е запомнен най-вече с играта на Джони. През следващата година Джони се снима във научно-фантастичния филм „Жената на астронавта“ (The Astronaut's Wife), който не се харесва особено на публиката. Джони участва и във филма на Роман Полански „Деветата порта“ (9th Gate).През последните години Джони Деп прави още редица участия. Ролята му във филма на Джулиан Шнабъл „Преди да падне нощта“ (Before Night Falls) получава положителни отзиви от критиката. Деп партнира на Кристина Ричи във филма „Мъжът, който плачеше“ (The Man Who Cried). Джони участва заедно с Жулиет Бинош във филма „Шоколад“, който е номиниран в 5 от категориите на наградите Оскар.Джони Деп участва в излезлия през 2003 г. филм „Карибски пирати“, както и в двете продължения на филма. Джони е любимец на режисьора Тим Бъртън, който го вкарва във много свои филми, един от който е Суини Тод- Бръснарят демон от Флийт Стрийт, излезнал у нас в началото на 2008